De acuerdo al Bando de Policía y Buen Gobierno, el municipio está integrado por la cabecera municipal, que es Almoloya del Río, y dos colonias: la Emiliano Zapata, antes Colonia Campesina y la López Mateos, antes La Puerta. La cabecera y ambas colonias están divididas para efectos de organización vecinal en dos cuarteles o barrios: Tecalco, al norte,Texcoapa, al sur y éstos a su vez, se dividen en dos secciones cada uno.
Cada comunidad elige democráticamente a sus delegados y los consejos de apoyo ciudadano, y tienen funciones de apoyo al ayuntamiento en las tareas administrativo de cada comunidad. Asimismo, se eligen las autoridades agrarias
Pertenece al distrito electoral federal México V con cabecera en Tenancingo y al V distrito electoral local, con cabecera en Tenango del Valle.
Se elige democráticamente al presidente municipal, síndico y regidores. Su ayuntamiento se conforma por la secretaría del ayuntamiento, los consejos de apoyo ciudadano, la Comisión de Planeación y Desarrollo, y por los delegados municipales. El departamento de Tesorería, el Departamento de Desarrollo Urbano, Obras y Servicios Públicos, la Sección Administrativa y la Comandancia.
